Гибель Евгения Кушнарева породила множество версий неофициального характера. Многие, если не большинство, связывают ее с нарастающими противоречиями внутри Партии регионов. В частности, речь идет об усилении разногласий между группами Ахметова и Януковича в ПР.
По словам политолога Костя Бондаренко, Кушнарева сразу же после парламентских выборов оттеснили в тень партийного руководства. «Евгений Кушнарев в этих конфликтах не был замешан, его роль в Партии была чисто символической, он не был человеком, который реально решал вопросы в Партии регионов», - отметил Бондаренко в комментарии корреспонденту «Вовремя.info».
Между тем, роль «комментатора текущих событий», отведенная Евгению Петровичу лидерами ПР, не вполне соответствовала его харизме и амбициям. Летом 2006 года появилась информация о том, что Кушнарев намерен участвовать в президентской кампании-2009 и даже начал создавать под этот проект оргструктуры.
Источник «Вовремя.info» во фракции Партии регионов говорит, что в конце зимы – начале весны Ахметов планировал отстранить Виктора Януковича от руководства Партией регионов и заменить его Раисой Богатыревой. Этот маневр давал возможность через какое-то время сменить на премьерском посту «непослушного» Януковича или просто держать его в напряжении.
Однако Янукович, в свою очередь, решил сыграть на опережение и поставить во главе Партии Евгения Кушнарева под предлогом того, что у премьер-министра мало времени для занятий партийными делами. Такая рокировка, когда пользующийся поддержкой своего электората Кушнарев возглавил бы Партию регионов, могла бы кардинально нарушить внутрипартийный - а в более широком плане - и общеполитический баланс в стране.
Смерть Евгения Кушнарева – в политическом смысле – невосполнимая потеря для партии. Но если версия о конфликте между Ахметовым и Януковичем имеет право на существование, то это, в первую очередь, сильнейший удар по Януковичу. Неудивительно, что он прервал свой визит в Турцию и вернулся в Украину, чтобы лично участвовать в организации похорон Евгения Петровича. Заслуживает внимания также первая реакция Януковича. Турецкие дипломаты указывают, что когда Реджеп Эрдоган сообщил, что Кушнарев пострадал в результате несчастного случая, Януковича проронил: «Они его убили…». Если это правда, то Виктор Янукович – в курсе того, что же произошло в действительности в Изюмском лесу 16 января 2007 года…